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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
27/04/2021 |
Actualizado : |
27/04/2021 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
SIMEONE, M.; GÓMEZ, C.; BERTALMIO, A.; RUIZ, E.; HAUTEVILLE, C.; GODOY, L.; TITO, B.; GARCÍA, M.L. |
Afiliación : |
MELINA SIMEONE, Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CCT-La Plata CONICET-UNLP Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina; CLAUDIO GÓMEZ, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ESPERANZA RUIZ, Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina; CLAUDIA HAUTEVILLE, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; LAURA GODOY SUÁREZ, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; BLAS TITO, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; MARÍA L. GARCÍA, Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CCT?La Plata CONICET?UNLP Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina. |
Título : |
Detection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters. |
Fecha de publicación : |
2021 |
Fuente / Imprenta : |
Plant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341 |
ISSN : |
0032-0862 |
DOI : |
10.1111/ppa.13341 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021.
This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP 2014‐3762, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) Proyectos de Investigación de Unidades Ejecutoras?(IBBM), Universidad Nacional de La Plata (UNLP) X‐692, and Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) (PNFRU‐1172; 11721; ERIOS‐630081, PD I081 and RIST I091). M.S. was supported by ANPCyT and CONICET. M.L.G. belongs to CONICET and Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP. We thank Beatriz Stein and Julia Figueroa from the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEOC), Tucumán, for providing samples from their collection and Magalí Gabrielli for technical assistance in the total RNA extractions. We thank Pedro Moreno for helpful discussion and critical reading of the manuscript. |
Contenido : |
ABSTRACT.
Citrus psorosis virus (CPsV) is the causal agent of psorosis, an important disease of citrus. Sanitary and certification programmes helped reduce disease damage caused by psorosis and other graft‐transmissible diseases in many citrus‐growing regions. For quarantine and certification programmes, most of these diseases are currently diagnosed using biological indexing (BI) on sensitive indicator plants. In the case of citrus psorosis, CPsV can be detected by molecular methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT‐qPCR), which is cheaper and faster than BI, but sensitivity, reliability, and reproducibility of both procedures have not been compared so far. In this work, 128 plants from Argentina and Uruguay were analysed using BI and CPsV detection by the RT‐qPCR assay. Almost perfect agreement between both diagnostic procedures and sensitivity, specificity, and estimated likelihood ratios indicate that RT‐qPCR is equivalent to BI for citrus psorosis diagnosis, thus providing confidence in the quick diagnostic procedure to monitor the sanitary status of citrus trees.
© 2021 British Society for Plant Pathology |
Palabras claves : |
Citrus psorosis virus; Diagnostic parameters; RT-qPCR. |
Asunto categoría : |
H20 Enfermedades de las plantas |
Marc : |
LEADER 03027naa a2200277 a 4500 001 1061995 005 2021-04-27 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0032-0862 024 7 $a10.1111/ppa.13341$2DOI 100 1 $aSIMEONE, M. 245 $aDetection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters.$h[electronic resource] 260 $c2021 500 $aArticle history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021. This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP 2014‐3762, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) Proyectos de Investigación de Unidades Ejecutoras?(IBBM), Universidad Nacional de La Plata (UNLP) X‐692, and Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) (PNFRU‐1172; 11721; ERIOS‐630081, PD I081 and RIST I091). M.S. was supported by ANPCyT and CONICET. M.L.G. belongs to CONICET and Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP. We thank Beatriz Stein and Julia Figueroa from the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEOC), Tucumán, for providing samples from their collection and Magalí Gabrielli for technical assistance in the total RNA extractions. We thank Pedro Moreno for helpful discussion and critical reading of the manuscript. 520 $aABSTRACT. Citrus psorosis virus (CPsV) is the causal agent of psorosis, an important disease of citrus. Sanitary and certification programmes helped reduce disease damage caused by psorosis and other graft‐transmissible diseases in many citrus‐growing regions. For quarantine and certification programmes, most of these diseases are currently diagnosed using biological indexing (BI) on sensitive indicator plants. In the case of citrus psorosis, CPsV can be detected by molecular methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT‐qPCR), which is cheaper and faster than BI, but sensitivity, reliability, and reproducibility of both procedures have not been compared so far. In this work, 128 plants from Argentina and Uruguay were analysed using BI and CPsV detection by the RT‐qPCR assay. Almost perfect agreement between both diagnostic procedures and sensitivity, specificity, and estimated likelihood ratios indicate that RT‐qPCR is equivalent to BI for citrus psorosis diagnosis, thus providing confidence in the quick diagnostic procedure to monitor the sanitary status of citrus trees. © 2021 British Society for Plant Pathology 653 $aCitrus psorosis virus 653 $aDiagnostic parameters 653 $aRT-qPCR 700 1 $aGÓMEZ, C. 700 1 $aBERTALMIO, A. 700 1 $aRUIZ, E. 700 1 $aHAUTEVILLE, C. 700 1 $aGODOY, L. 700 1 $aTITO, B. 700 1 $aGARCÍA, M.L. 773 $tPlant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341
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Registros recuperados : 35 | |
8. | | RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; RIVAS, F.; COLINA, R.; BENÍTEZ, M. J.; MAESO, D. Caracterización molecular y biológica de aislamientos de campo de CTV de Uruguay y su potencial en la protección cruzada. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Universidad de la República (UdelaR), Facultad de Agronomía. Simposio Nacional, 4. y Congreso Latinoamericano, 1. ?Investigación y Desarrollo Tecnológico en Citrus?, 3-5 noviembre 2014, Montevideo (Uruguay). p. 1-4.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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9. | | BENÍTEZ, M. J.; BERTALMIO, A.; RUBIO, L.; RIVAS, F.; MAESO, D.; COLINA, R. Caracterización molecular y filodinámica del virus de la tristeza de los cítricos. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Universidad de la República (UdelaR), Facultad de Agronomía. Simposio Nacional, 4. y Congreso Latinoamericano, 1. ?Investigación y Desarrollo Tecnológico en Citrus?, 3-5 noviembre 2014, Montevideo (Uruguay). p. 1-4.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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11. | | BENÍTEZ, M.J.; BERTONI, E.; BERTALMIO, A.; RUBIO, L.; RIVAS, C.; MAESO, D.; COLINA, R. Detección y caracterización de virus y viroides en la Citricultura del Uruguay: aportes sobre el nuevo linaje de CTV en Sudamérica y su repercusión en la protección cruzada. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Citrícola. Resultados de investigación en Citricultura: Genética, Sanidad, Productividad. Salto (Uruguay): INIA, 2015. p. 107-112 (Serie Actividades de Difusión; 752).Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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13. | | HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, L.; BERTALMIO, A.; RUBIO, L.; ROLON, R.; MAESO, D.; RIVAS, F. Inability of the brown citrus aphid (Toxoptera citricida) to transmit citrus psorosis virus under controlled conditions. (Brief report). Journal of Citrus Pathology, 2020, volume 7, issue 1, 45702. OPEN ACCESS. Permalink: https://escholarship.org/uc/item/8m62q3pj Article history: Published online: 2020.
Supplementary material: https://escholarship.org/uc/item/8m62q3pj#supplemental
Corresponding author: L. Hernández-Rodríguez, email: lesterhernandeziift@gmail.comTipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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16. | | BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; MAESO, D.; RIVAS, F.; COLINA, R. Phylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage. Viruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS. Article history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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17. | | MAESO, D.; RUBIO, L.; BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; HERNÁNDEZ, L.; BERTALMIO, A.; ARRUABARRENA, A.; RIVAS, F.; COLINA, R. Aportes al conocimiento de Citrus tristeza virus en Uruguay. [resumen] In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); INIA Las Brujas; Biotecnología. Jornada de Agrobiotecnología, XI. Encuentro Nacional de REDBIO, III. Jornada técnica. Las Brujas, Canelones (UY): INIA, 2018. p. 12 (Serie Actividades de Difusión; 786)Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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18. | | SIMEONE, M.; GÓMEZ, C.; BERTALMIO, A.; RUIZ, E.; HAUTEVILLE, C.; GODOY, L.; TITO, B.; GARCÍA, M.L. Detection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters. Plant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341 Article history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021.
This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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19. | | RIVAS, F.; BERNAL, R.; BERTALMIO, A.; BUENAHORA, J.; GOÑI, C.; LADO, J.; PEREZ, E.; OTERO, A.; MARA, H. La citricultura bajo estrés: un enfoque integral. Revista INIA, 2009, no. 17, p. 68-72.Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó; INIA Treinta y Tres. |
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20. | | HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, L.; BERTALMIO, A.; ARRUABARRENA, A.; RUBIO, L.; RIVAS, F.; BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; COLINA, R.; MAESO, D. First Report of the Citrus tristeza virus Trifoliate Resistance-Breaking (RB) Genotype in "Newhall" Sweet Orange in South America Plant Disease, 2017, v.101 (6), p.1063. (Abstract) DISEASE NOTES: Posted online on 30 Mar 2017.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
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